MySQL-DB Problem nach umdate von RC3 auf RC4

Erstmal Happy New Year!
Also mein Problem ist folgendes. Ich benutze J!1.5 RC4 Revision 9784. Dateimässig läuft alles prima. Jedoch habe ich bei meiner SQL-DB so einige Probleme.
Die DB stammt noch von RC3 her. Die habe ich dann mit dem im Installer mitgelieferten Updatetool RC3->RC4.sql aktualisieren lassen. Dabei gab es einige Fehler. Weiss nicht ob dann das SQL-Skript stoppt oder ob die restlichen Operationen trozdem durchführt wurden.
z.B: generiert es mir ab RC4 keine PDF's mehr (in RC3 ging es) und im Backend kann ich keine Bilder einfügen, da der Lightbox-Effekt nicht mehr geht. Auch das ging in RC3. Dies hat aber 100% sicher mit der DB zu tun, weil bei einer neuen, leeren DB und den gleichen Files funktioniert alles bestens. Sobald ich meine DB verwende gehts nicht mehr.
nun meine Fragen:
1. kann man das beheben ohne eine Neuauflage meiner DB? und am besten wie?
2. wo in der DB muss ich anfangen zu suchen
3. gibt es Analyse- oder Compare-Tools, die mir vielleicht aufzeigen würden, wo meine DB nicht korrekt ist?
Ich hoffe ich bekomme ein paar gute Tipps von euch. Danke.

Update:
Habe nun nach 4h pröbeln herausgefunden, dass der Lightbox-Popup für die Bearbeitung der Kategorie- resp. Bereichsinhalte funktioniert. Es spuckt also "nur" bei den Artikeln.