Wie schon gesagt, wenn diese Links bei dir nirgends auf der Seite stehen, werden sie auch von keiner Suchmaschine indexiert, und du hast auch kein Problem damit.
ein großes Joomla - Problem scheint die massenhafte Generierung von Links zu sein.
Wie ist das genau gemeint? Joomla generiert genau die Links, die du willst (Menu, Text, Template u.s.w.) und kein Stück mehr!
Fehlerhafte Links abfangen hingegen, ja das stimmt. Ist aber auch komplett was anderes. Aber wenn ein CMS-System versucht, falsche Links abzufangen und statt einer schnöden 404-Seite trotzdem Inhalt anzuzeigen, so ist das doch mehr ein Feature, oder nicht?
Im Fall von z.B. joomla.ch/2 wird im Joomla-Router (\libraries\cms\router\site.php) zuerst ein Menupunkt mit dem Alias 2 gesucht. Falls nicht gefunden wird ein Menupunkt mit der entsprechender Id (=Itemid) gesucht. Wird auch das nicht gefunden, gibt's einen Fallback auf den sog. Home-Menupunkt.
Von diesem Default-Menupunkt wird die Komponente ausgelesen und als URL-Parameter gesetzt. Und wenn das eine Ansicht der Content-Komponente ist (Article, Categorie, Featured...), wird als Komponenten-Parameter 'com_content' gesetzt. Das wäre dann bei ca. 98% aller J-Seiten der Fall.
Dann wird die Routerdatei der 'gesetzten' Komponente aufgerufen (mit dem Parameter 2 in unserem Beispiel, \components\com_content\router.php). Und da wird bei der com_content als Fallback bei nicht gesetztem View-Parameter die default View 'Article' gewählt, immer noch mit Parameter 2.
Und das Ganze ergibt dann die Beitrags-Ansicht vom Artikel mit der Id 2, und den Template- und Modulzuweisungen von Standard- rsp. 'Home'-Menupunkt.
(vorausgesetzt der Artikel existiert, ist published und der Access-View Level stimmt. Ansonstent gibt's ne 404 mit z.B. 'Beitrag nicht gefunden', o.ä.)
Versuch mal
www.joomla.ch/2
www.joomla.ch/22
www.joomla.ch/222
Dann siehst es.
Und compontent/content hast du eigentlich meist auch nur, wenn du was direkt per URL aufrufst, was keinen eigenen Menupunkt hat. Ist aus User Sicht auch eher unwahrscheinlich.